Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms