Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b6P59708 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms