Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhbdl3P58873 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms