Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp3P58854 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp3P58854 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp3P58854 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubgcp3P58854 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp3P58854 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp3P58854 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp3P58854 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubgcp3P58854 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp3P58854 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms