Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpa1P57784 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms