Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtnsP57757 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtnsP57757 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtnsP57757 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms