Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms