Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms