Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd38P56528 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms