Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gp1bbP56400 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms