Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ephb3P54754 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms