Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PctpP53808 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PctpP53808 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PctpP53808 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PctpP53808 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PctpP53808 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PctpP53808 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PctpP53808 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PctpP53808 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PctpP53808 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PctpP53808 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PctpP53808 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PctpP53808 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PctpP53808 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PctpP53808 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PctpP53808 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PctpP53808 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PctpP53808 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PctpP53808 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PctpP53808 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PctpP53808 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PctpP53808 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PctpP53808 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PctpP53808 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms