Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux1P53564 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux1P53564 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux1P53564 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux1P53564 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux1P53564 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cux1P53564 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cux1P53564 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux1P53564 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms