Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms