Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pold1P52431 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pold1P52431 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pold1P52431 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pold1P52431 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pold1P52431 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms