Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LumP51885 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LumP51885 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LumP51885 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LumP51885 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LumP51885 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LumP51885 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LumP51885 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LumP51885 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LumP51885 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LumP51885 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LumP51885 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms