Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr5P51682 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms