Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CastP51125 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CastP51125 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CastP51125 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CastP51125 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CastP51125 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CastP51125 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CastP51125 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CastP51125 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CastP51125 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CastP51125 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CastP51125 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CastP51125 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CastP51125 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CastP51125 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CastP51125 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CastP51125 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CastP51125 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CastP51125 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CastP51125 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CastP51125 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CastP51125 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CastP51125 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms