Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs12P50716 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs12P50716 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms