Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc3P49135 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms