Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CitP49025 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CitP49025 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CitP49025 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CitP49025 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CitP49025 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CitP49025 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CitP49025 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CitP49025 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CitP49025 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CitP49025 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms