Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prox1P48437 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms