Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Resp18P47939 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Resp18P47939 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Resp18P47939 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Resp18P47939 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Resp18P47939 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms