Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrprbP47758 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrprbP47758 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrprbP47758 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms