Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nedd4P46935 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nedd4P46935 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nedd4P46935 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Nedd4P46935 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd4P46935 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd4P46935 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd4P46935 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nedd4P46935 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd4P46935 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nedd4P46935 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd4P46935 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd4P46935 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd4P46935 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nedd4P46935 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd4P46935 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd4P46935 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd4P46935 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd4P46935 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd4P46935 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd4P46935 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd4P46935 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd4P46935 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd4P46935 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd4P46935 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd4P46935 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd4P46935 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd4P46935 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nedd4P46935 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd4P46935 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd4P46935 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd4P46935 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd4P46935 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd4P46935 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd4P46935 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms