Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf1P46099 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf1P46099 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms