Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms