Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tlx1P43345 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlx1P43345 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms