Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtbP41155 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbP41155 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbP41155 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbP41155 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbP41155 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbP41155 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbP41155 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbP41155 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtbP41155 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbP41155 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbP41155 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbP41155 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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