Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TfamP40630 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TfamP40630 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TfamP40630 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TfamP40630 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TfamP40630 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TfamP40630 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TfamP40630 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TfamP40630 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TfamP40630 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms