Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf1P39428 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf1P39428 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf1P39428 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf1P39428 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf1P39428 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf1P39428 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf1P39428 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf1P39428 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf1P39428 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms