Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpargP37238 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PpargP37238 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PpargP37238 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PpargP37238 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpargP37238 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpargP37238 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpargP37238 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpargP37238 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpargP37238 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpargP37238 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpargP37238 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms