Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6fP35460 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6fP35460 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms