Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TpoP35419 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TpoP35419 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TpoP35419 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TpoP35419 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TpoP35419 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TpoP35419 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TpoP35419 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TpoP35419 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TpoP35419 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TpoP35419 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TpoP35419 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TpoP35419 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms