Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsx2P31316 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx2P31316 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms