Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms