Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Etv4P28322 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Etv4P28322 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms