Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms