Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CftrP26361 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CftrP26361 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CftrP26361 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CftrP26361 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CftrP26361 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CftrP26361 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CftrP26361 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CftrP26361 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CftrP26361 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CftrP26361 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CftrP26361 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CftrP26361 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CftrP26361 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CftrP26361 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CftrP26361 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CftrP26361 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CftrP26361 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CftrP26361 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CftrP26361 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CftrP26361 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CftrP26361 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CftrP26361 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CftrP26361 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CftrP26361 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CftrP26361 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CftrP26361 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CftrP26361 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CftrP26361 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CftrP26361 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CftrP26361 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CftrP26361 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CftrP26361 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CftrP26361 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CftrP26361 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CftrP26361 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CftrP26361 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CftrP26361 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CftrP26361 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CftrP26361 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CftrP26361 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CftrP26361 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CftrP26361 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CftrP26361 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CftrP26361 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CftrP26361 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CftrP26361 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CftrP26361 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CftrP26361 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CftrP26361 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CftrP26361 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CftrP26361 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CftrP26361 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CftrP26361 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CftrP26361 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CftrP26361 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CftrP26361 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CftrP26361 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms