Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf239P24399 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf239P24399 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf239P24399 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms