Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp36P22893 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp36P22893 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms