Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou3f1P21952 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms