Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prim1P20664 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prim1P20664 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prim1P20664 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prim1P20664 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prim1P20664 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim1P20664 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim1P20664 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim1P20664 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms