Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ms4a2P20490 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ms4a2P20490 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ms4a2P20490 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms