Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TP20293 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TP20293 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TP20293 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TP20293 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TP20293 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TP20293 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TP20293 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TP20293 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TP20293 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TP20293 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TP20293 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TP20293 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TP20293 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TP20293 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP20293 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms