Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ms4a1P19437 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a1P19437 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms