Protein–RNA interactions for Protein: P18419

Svs4, Seminal vesicle secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs4P18419 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Svs4P18419 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Svs4P18419 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms