Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gabra6P16305 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra6P16305 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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