Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd44P15379 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd44P15379 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd44P15379 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd44P15379 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd44P15379 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms