Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lamp1P11438 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lamp1P11438 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lamp1P11438 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lamp1P11438 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lamp1P11438 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lamp1P11438 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lamp1P11438 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms